Il progetto è finalizzato a istituire un governo comune delle attività di pesca e acquacoltura nel mare Adriatico, il cui fine ultimo è la tutela della biodiversità e delle risorse marine. L'obiettivo generale del progetto ARGOS è ravvisabile nella Promozione di un approccio integrato comune nella protezione delle risorse ittiche e marine e il miglioramento delle condizioni di qualità ambientale del mare Adriatico attraverso azioni multilivello orientate a ridurre, sia direttamente che indirettamente, la pressione delle attività di pesca e dell'acquacoltura sull'ambiente marino.

In tale ottica si colloca, inoltre, l’istituzione del Consiglio Consultivo scientifico dell'Adriatico (CAA), organismo che affianca il Comitato di Sorveglianza ed è preposto alla definizione di raccomandazioni propedeutiche alle attività di ricerca e agli obiettivi da raggiungere.

Le azioni da porre in essere comprendono la creazione di un quadro normativo comune e condiviso per la gestione della pesca e dell'acquacoltura e il collegamento in rete dei principali stakeholders, attraverso il confronto e l'integrazione tra le banche dati esistenti e l'istituzione di una cooperazione transfrontaliera come quadro per le attività di formazione e istruzione dei soggetti operanti nel settore della pesca e dell'acquacoltura.